Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMEM248Q9NWD8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM248Q9NWD8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms