Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms