Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms