Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms