Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM7Q9NQW5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM7Q9NQW5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM7Q9NQW5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM7Q9NQW5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM7Q9NQW5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM7Q9NQW5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM7Q9NQW5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM7Q9NQW5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM7Q9NQW5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM7Q9NQW5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM7Q9NQW5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM7Q9NQW5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM7Q9NQW5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM7Q9NQW5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM7Q9NQW5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM7Q9NQW5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM7Q9NQW5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM7Q9NQW5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM7Q9NQW5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRDM7Q9NQW5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PRDM7Q9NQW5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM7Q9NQW5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms