Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms