Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1B3Q9NPD5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms