Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms