Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms