Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms