Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3Q9H3W5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms