Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms