Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SHANK3Q9BYB0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK3Q9BYB0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms