Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARD11Q9BXL7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms