Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms