Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms