Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms