Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A3Q9BRY0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms