Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3CQ99985 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms