Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms