Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CICQ96RK0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms