Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms