Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms