Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms