Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms