Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms