Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms