Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms