Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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