Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC136Q96JN2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms