Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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