Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms