Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms