Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms