Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC11Q96DB2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms