Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms