Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEO1Q92859 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms