Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms