Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms