Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms