Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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TMIEQ8NEW7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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TMIEQ8NEW7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIEQ8NEW7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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