Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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ZNF248Q8NDW4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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