Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CARMIL3Q8ND23 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CARMIL3Q8ND23 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CARMIL3Q8ND23 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CARMIL3Q8ND23 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CARMIL3Q8ND23 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CARMIL3Q8ND23 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CARMIL3Q8ND23 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CARMIL3Q8ND23 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CARMIL3Q8ND23 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CARMIL3Q8ND23 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CARMIL3Q8ND23 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CARMIL3Q8ND23 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CARMIL3Q8ND23 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CARMIL3Q8ND23 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARMIL3Q8ND23 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARMIL3Q8ND23 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARMIL3Q8ND23 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARMIL3Q8ND23 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARMIL3Q8ND23 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARMIL3Q8ND23 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms