Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM35BQ8NCS4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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