Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms