Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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