Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
PLD3Q8IV08 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms