Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms