Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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