Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms